Cel badania FloraGEN ma na celu szczegółową charakterystykę mikrobioty jelitowej pacjenta poprzez analizę DNA bakterii obecnych w próbce kału. Badanie pozwala określić skład gatunkowy, względną obfitość oraz wskaźniki różnorodności mikroorganizmów, co umożliwia wykrycie dysbiozy – zaburzenia równowagi bakteryjnej, które może wpływać na układ nerwowy, immunologiczny i metaboliczny.
Wskazania kliniczne Zaburzenia neurorozwojowe, w tym autyzm (ASD), zespół PANS/PANDAS, ADHD, opóźnienia rozwojowe. Przewlekłe dolegliwości żołądkowo-jelitowe: biegunki, zaparcia, wzdęcia, ból brzucha. Objawy związane z dysbiozą: nietolerancje pokarmowe, nadmierna fermentacja, zaburzenia nastroju. Ocena wpływu długotrwałego stosowania antybiotyków, probiotyków lub diety eliminacyjnej. Choroby metaboliczne i immunologiczne, które mogą mieć podłoże w zaburzeniach mikrobioty (np.
otyłość, cukrzyca typu 2, choroby autoimmunologiczne). Materiał i przygotowanie pacjenta Do badania wymagana jest jednorazowa próbka kału (minimum 5 g) pobrana w warunkach domowych przy użyciu sterylnego pojemnika dostarczonego przez laboratorium. Unikaj przyjmowania probiotyków, prebiotyków oraz suplementów zawierających żywe kultury bakterii na co najmniej 48 h przed pobraniem próbki.
Nie stosuj środków przeczyszczających ani nie przeprowadzaj kolonoskopii w ciągu 7 dni przed badaniem. Próbkę należy umieścić w dostarczonym pojemniku, szczelnie zamknąć i przechowywać w temperaturze 2‑8 °C (lodówka). Dostarczyć do laboratorium najpóźniej w ciągu 24 h od pobrania.
Metoda Analiza opiera się na sekwencjonowaniu regionu 16S rRNA (metoda 16S‑rRNA gene sequencing) lub pełnym metagenomicznym sekwencjonowaniu (shot‑gun metagenomics), co pozwala na identyfikację bakterii do poziomu gatunku oraz ocenę funkcjonalnych potencjałów mikrobiomu. Amplifikacja wybranych fragmentów genów bakteryjnych. Selektywne sekwencjonowanie przy użyciu platformy NGS (np.
Bioinformatyczna analiza danych: klasyfikacja taksonomiczna, obliczenie wskaźników alfa‑ i beta‑różnorodności, predykcja szlaków metabolicznych. Interpretacja wyników Raport zawiera: Profil względnej abundancji najważniejszych grup bakterii (np. Firmicutes, Bacteroidetes, Actinobacteria, Proteobacteria). Shannon, Simpson) – niskie wartości mogą wskazywać na dysbiozę. Wykrycie potencjalnie patogennych lub nadmiernie rozmnożonych taksonów (np.