Cel badania Badanie ma na celu wykrycie w próbce kału materiału genetycznego (RNA lub DNA) sześciu najważniejszych wirusów wywołujących zakażenia żołądkowo-jelitowe: Norovirus GI i GII, Rotavirus A, Adenovirus F (serotypy 40/41), Astrovirus oraz Sapovirus. Dzięki technice reakcji łańcuchowej polimerazy w czasie rzeczywistym (qPCR) możliwe jest szybkie i bardzo czułe potwierdzenie aktywnej infekcji.
Wskazania kliniczne Ostra biegunka, wymioty, bóle brzuszne i podwyższona temperatura, zwłaszcza u niemowląt i małych dzieci. Przewlekłe lub nawracające objawy ze strony przewodu pokarmowego, gdy podejrzewa się podłożą wirusowe. Osoby z osłabioną odpornością – po przeszczepach, w trakcie chemioterapii, przy chorobach nowotworowych lub przyjmujące leki immunosupresyjne.
Pacjenci z zaburzeniami neurorozwojowymi (autyzm, ASD, PANS/PANDAS) wykazujący nasilone dolegliwości żołądkowo-jelitowe, które mogą modulować zachowanie i funkcje poznawcze. Monitorowanie i kontrola ognisk wirusowych w placówkach opieki zdrowotnej, przedszkolach i szkołach. Materiał biologiczny Świeża lub zamrożona próbka kału – minimalna objętość 2 g, pobrana w sterylnym pojemniku jednorazowym.
Metoda Procedura opiera się na wysoce specyficznej reakcji łańcuchowej polimerazy w czasie rzeczywistym (qPCR): Izolacja RNA/DNA z kału przy użyciu zestawu dedykowanego do materiału fekalnego. W przypadku wirusów RNA (Norovirus, Rotavirus) przeprowadza się odwróconą transkrypcję do cDNA. Amplifikacja przy użyciu zestawu primerów i sond hybrydowych charakterystycznych dla każdego z wirusów.
Analiza krzywej amplifikacji – pojawienie się sygnału w określonym cyklu (Ct) potwierdza obecność genomu wirusa. Limit wykrywalności wynosi zazwyczaj Przygotowanie pacjenta Nie wymaga specjalnej diety ani odstawiania leków, jednak zaleca się: Unikanie podawania probiotyków i antybiotyków w ciągu 24 h przed pobraniem, o ile to możliwe. Zebranie próbki w czystym, jednorazowym pojemniku, bez dodatku wody, soli czy innych substancji.
Transport w temperaturze 2‑8 °C do 24 h od pobrania; przy dłuższym czasie przechowywać zamrożone w –20 °C. Interpretacja wyników Wynik dodatni – wykryto materiał genetyczny jednego lub kilku wirusów z panelu; wskazuje na bieżącą infekcję, co uzasadnia leczenie objawowe oraz wdrożenie środków izolacyjnych. Wynik ujemny – nie stwierdzono obecności badanych wirusów; przyczyną objawów mogą być bakterie, pasożyty, wirusy nieobjęte panelem lub zaburzenia nieinfekcyjne (np.